Die Insel im Süden ist eine kleine Insel im Süden der Hoenn-Region, die nur per Schiff erreichbar ist.
Nur selten kommen Besucher hierher, da viele nicht einmal von der Existenz dieser kleinen Insel wissen.
Um im Spiel zu ihr zu gelangen, benötigt man das Äon-Ticket, das man nur bei einer Nintendo-Aktion, dem Pokémon Day 2004, erhalten konnte. In den USA und (was kaum bekannt ist) Japan konnte man sich mit einer Promokarte für den Nintendo e-Reader das Äon-Ticket runterladen.
Die Insel im Süden wird als die Heimat von Latias und Latios gegen Ende des Smaragd Arc erwähnt, da die beiden Legendären Pokémon dorthin zurückkehren. Rubin besucht die Insel während Episode 1 und lockt zunächst Latias, das wieder einmal die Gestalt einer Frau angenommen hat, mit dem Klang der Äon-Flöte heraus. Er begrüßt die alte Freundin und als auch Latios erscheint, bittet er es, ihn zu begleiten. Gemeinsam verlassen Rubin und Latios die Insel nun wieder, um die aufkommende Krise durch einen Meteoriten zu bekämpfen.